Якщо прикоренева частина стебла тоншає і темніє і розсада полягає, швидше за все, вона уражена чорною ніжкою.
Найчастіше інфікування відбувається через ґрунт, який не продезінфікували перед посівом насіння. Провокує хворобу надмірний полив, густий посів, відсутність дренажу, недотримання температурних режимів при вирощуванні розсади, погана вентиляція.
За перших ознак ураження хворі сіянці видаляють із невеличкою грудкою землі, на деякий час припиняють полив і підсипають до сіянців пісок. Потім поливають слабким розчином марганцівки чи фунгіциду. Але найкраще в такій ситуації пересадити розсаду в новий знезаражений ґрунт. Подбайте про утеплення підвіконня та не допускайте протягів. Надалі висівайте насіння лише у простерилізований ґрунт і не допускайте загущення посівів. Аби не допустити масового зараження, висівайте насіння окремо в касети чи торфоперегнійні горщики.
Перед посівом насіння корисно обробити в розчині фунгіцидів.